Ce secteur assure les analyses bactériologiques conventionnelles (isolement en culture et identification des bactéries, antibiogrammes), et les analyses de sérologie bactérienne.

Le plateau technique de bactériologie/parasitologie est composé de : 

• Microscope binoculaire ( LEICA - DM750)
• Système d'identification microbienne et antibiogramme ( BIOMERIEUX - Vitek 2 compact 15)
• Densitomètre ( BIOMERIEUX - DENSICHEK Plus )
• Enceinte de sécurité microbiologique (Hotte à flux laminaire) /BIOAIR - Topsafe 1.2 
• Microscope à fluorescence ( ZEISS - AX10-Lab. A1 )
• Balance de précision (KERN-  PLJ 3000)
• Bain-marie  (THERMO  - PRECISION )
• Agitateur (Vortex  - LMR VTX500 )
• Incubateur (Nahita  - 636 Plus )
• autoclave de paillasse Vertical ( ASAL  - 760 ) 
• autoclave de paillasse Horizontal (Thermo Scientific - 9000-D)
• Agitateur magnetique à plaque chauffante  ( VWR - DYLADUAL )
• Distributeur adaptable sur flacon  (DISPENSETTE III - BRANG Analog)
• Refrigérateur +04°C ( INNOVA - IN168 ).